| 第1回 | （昭和32年） | 中央大学 |
| 第2回 | （昭和33年） | 慶応義塾大学 |
| 第3回 | （昭和34年） | 慶応義塾大学 |
| 第4回 | （昭和35年） | 東京大学 |
| 第5回 | (昭和36年） | 中央大学 |
| 第6回 | (昭和37年） | 東京大学 |
| 第7回 | (昭和38年) | 慶応義塾大学 |
| 第8回 | (昭和39年） | 明治大学 |
| 第9回 | (昭和40年） | 広島大学 |
| 第10回 | (昭和41年) | 北海道大学 |
| 第11回 | (昭和42年) | 京都大学 |
| 第12回 | (昭和43年） | 日本大学 |
| 第13回 | (昭和44年) | 中央大学 |
| 第14回 | (昭和45年) | 早稲田大学 |
| 第15回 | (昭和46年) | 早稲田大学 |
| 第16回 | (昭和47年) | 早稲田大学 |
| 第17回 | (昭和48年) | 早稲田大学 |
| 第18回 | (昭和49年) | 九州大学 |
| 第19回 | (昭和50年) | 東京大学 |
| 第20回 | (昭和51年) | 九州大学 |
| 第21回 | (昭和52年) | 東京大学 |
| 第22回 | (昭和53年) | 慶応義塾大学 |
| 第23回 | (昭和54年) | 京都大学 |
| 第24回 | (昭和55年) | 慶応義塾大学 |
| 第25回 | (昭和56年) | 京都大学 |
| 第26回 | (昭和57年) | 東京大学 |
| 第27回 | (昭和58年) | 大阪大学 |
| 第28回 | (昭和59年) | 東北大学 |
| 第29回 | (昭和60年) | 東北大学 |
| 第30回 | （昭和61年) | 東北大学 |
| 第31回 | (昭和62年) | 東北大学 |
| 第32回 | (昭和63年) | 東京大学 |
| 第33回 | (平成元年) | 東北大学 |
| 第34回 | (平成2年) | 東京大学 |
| 第35回 | (平成3年) | 東京大学 |
| 第36回 | (平成4年) | 東京大学 |
| 第37回 | (平成5年) | 北海道大学 |
| 第38回 | (平成6年) | 東京大学 |
| 第39回 | (平成7年) | 北海道大学 |
| 第40回 | (平成8年) | 早稲田大学 |
| 第41回 | (平成9年) | 京都大学 |
| 第42回 | (平成10年) | 京都大学 |
| 第43回 | (平成11年) | 東京大学 |
| 第44回 | (平成12年) | 早稲田大学 |
| 第45回 | (平成13年) | 早稲田大学 |
| 第46回 | (平成14年) | 東京大学 |
| 第47回 | (平成15年) | 東京大学 |
| 第48回 | (平成16年) | 立命館大学 |
| 第49回 | (平成17年) | 立命館大学 |
| 第50回 | (平成18年) | 早稲田大学 |
| 第51回 | (平成19年) | 早稲田大学 |
| 第52回 | (平成20年) | 立命館大学 |
| 第53回 | (平成21年) | 立命館大学 |
| 第54回 | (平成22年) | 早稲田大学 |
| 第55回 | (平成23年) | 早稲田大学 |
| 第56回 | (平成24年) | 立命館大学 |
| 第57回 | (平成25年) | 早稲田大学 |
| 第58回 | (平成26年) | 早稲田大学 |
| 第59回 | (平成27年) | 立命館大学 |
| 第60回 | (平成28年) | 早稲田大学 |
| 第61回 | (平成29年) | 立命館大学 |
| 第62回 | (平成30年) | 早稲田大学 |
| 第63回 | (令和元年度) | 立命館大学 |
| 第64回 | (令和2年度) | コロナにより中止 |
| 第65回 | (令和3年度) | 京都大学 |
| 第66回 | (令和4年度) | 京都大学 |
全日本大学囲碁選手権 歴代優勝校
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